More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3300 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  100 
 
 
284 aa  543  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  37.07 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  35.55 
 
 
302 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  34.35 
 
 
299 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  36.21 
 
 
285 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  38.31 
 
 
373 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  32 
 
 
293 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  34.65 
 
 
304 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
293 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  33.45 
 
 
347 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
294 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  33.92 
 
 
273 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.76 
 
 
303 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
292 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
277 aa  99  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
292 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  35.93 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.89 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.77 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.35 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.77 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.55 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  32.76 
 
 
341 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
341 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.57 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  31.42 
 
 
289 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
295 aa  89  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.63 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.7 
 
 
317 aa  87  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  31.14 
 
 
290 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 
289 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  28.38 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.65 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  33.56 
 
 
324 aa  86.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  30.34 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  34.14 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  32.86 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.54 
 
 
292 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  32.99 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
295 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  32.2 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.43 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  33.92 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  30.85 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  33 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  30.98 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  40.1 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  31.44 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.01 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  31.96 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.41 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.97 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  35.32 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  31.01 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  32.99 
 
 
339 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  31.77 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  32.97 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  31.89 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.34 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  28.97 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.45 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  32.78 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.72 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  30.14 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  29.55 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.07 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  32.67 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  31.07 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  32.2 
 
 
301 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>