More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2171 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  295  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  46.9 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  34.72 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  35.17 
 
 
142 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
138 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  34.97 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.41 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.72 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.41 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
139 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.72 
 
 
142 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.25 
 
 
149 aa  83.6  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.57 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  34.03 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.66 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.1 
 
 
320 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.66 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  33.11 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  33.56 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  33.11 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.27 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  33.33 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  35.86 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  35.86 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  35.86 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.53 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.51 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.1 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  34.72 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.07 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.94 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  30.34 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  36.05 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  35.17 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.66 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.17 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  28.28 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30.14 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.76 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  33.57 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  35.21 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.94 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.11 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  28.97 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  30.41 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  30.14 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  35.37 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.67 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
278 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.11 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  33.1 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  31.03 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.29 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.93 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  31.76 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.65 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  31.29 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  31.25 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.45 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.41 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  36.3 
 
 
289 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  31.25 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.45 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.82 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.45 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.45 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.45 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  28.77 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  33.55 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.66 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.21 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.45 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.45 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.56 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.03 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.35 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.69 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>