225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0192 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0192  UspA domain protein  100 
 
 
288 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  37.22 
 
 
343 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  35.55 
 
 
295 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.79 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.67 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.84 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.84 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  35.97 
 
 
304 aa  95.5  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.69 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.41 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.31 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.62 
 
 
288 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  34.04 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.51 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.61 
 
 
317 aa  89  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  34.74 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  35.44 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.45 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.01 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.34 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.34 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.34 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.64 
 
 
293 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
293 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.18 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.19 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  33.33 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  36.15 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.44 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  34.88 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  31.76 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.05 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.88 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.67 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  30.03 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  35.12 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  35.03 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35.05 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.42 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.3 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  34.33 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.6 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  32.79 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.59 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  32.87 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  32.37 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.7 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  30.56 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  34.75 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  33.46 
 
 
287 aa  72  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  36.49 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  32.66 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  34.98 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  32.18 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  36.49 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  39.52 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  32.54 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.4 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.1 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  30.94 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  30.99 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  31.45 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  31.38 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  32.04 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  31.16 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  29.25 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  33.5 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.24 
 
 
296 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>