More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1479 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  100 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.1 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  38.83 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  38.83 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  41.24 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  40.89 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  41.3 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  38.14 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  38.62 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  39.06 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  40.83 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  40.68 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  36.05 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  36.05 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  37.07 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  36.93 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  37.07 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  39.8 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  40.07 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.84 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  40.07 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  40.2 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  38.23 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  37.63 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  39.86 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  38.8 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  38.8 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  38.8 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  35.83 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  41.08 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  39.38 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  40.2 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.41 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.46 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  40.08 
 
 		 393 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  39.79 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  38.14 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  38.89 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.86 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  37.38 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.33 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.36 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.94 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  38.74 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.41 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.63 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  40.61 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  38.28 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  36.55 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  36.12 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.86 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  35.76 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  36.99 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  36.3 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  34.03 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  43.81 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  40.07 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  35.35 
 
 		 341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.25 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  33.56 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  41.95 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  33.52 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  34.93 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.05 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  38.05 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  32.63 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  39.44 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  37.98 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>