193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18580 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18580  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 272 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  31.62 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  29.39 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.75 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  30.36 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.96 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.02 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.29 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.09 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.77 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.05 
 
 		 295 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.05 
 
 		 295 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.05 
 
 		 295 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  37.04 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  35.21 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  38.57 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  29.67 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  30.85 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.93 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  29.33 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.45 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  31.6 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  27.44 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  36.88 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.86 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  29.17 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  27.99 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  39.02 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  35 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  37.41 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  35 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  30.55 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  32.41 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.78 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.17 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.95 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  37.59 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  32.12 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  37.41 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  29.78 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  32.19 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.13 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.45 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  34.51 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  34.75 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.09 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.7 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.7 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34.31 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.55 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  32.67 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  26.64 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  32.14 
 
 		 147 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  28.46 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  33.95 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  35.54 
 
 		 183 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  31.79 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  26.46 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 		 144 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  28.15 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  32.14 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  33.56 
 
 		 323 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>