More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2137 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  302  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  70.59 
 
 
152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  51.06 
 
 
149 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  47.55 
 
 
155 aa  124  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  43.7 
 
 
143 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  46.43 
 
 
159 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 
144 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 
294 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  37.41 
 
 
170 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
296 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  38.81 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  43.28 
 
 
277 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  41.67 
 
 
339 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
151 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 
164 aa  84.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  43.06 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  39.29 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  42.66 
 
 
296 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  41.79 
 
 
277 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  38.73 
 
 
306 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.03 
 
 
284 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  41.3 
 
 
288 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  36.62 
 
 
192 aa  80.1  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  38.03 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  39.13 
 
 
293 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  41.04 
 
 
305 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  35.71 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  36.43 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  38.78 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  37.96 
 
 
305 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  35.97 
 
 
317 aa  74.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 
297 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  40 
 
 
294 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  37.12 
 
 
293 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  40 
 
 
294 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  40 
 
 
294 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  39.86 
 
 
303 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.88 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  40.29 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  45.45 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  35.46 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  38.06 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.44 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
293 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  38.85 
 
 
289 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.56 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  36.96 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  38.41 
 
 
301 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
292 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  37.86 
 
 
305 aa  70.5  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
295 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  38.13 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  42.86 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.81 
 
 
288 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  33.56 
 
 
296 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
341 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
288 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
287 aa  67  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
293 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.46 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.81 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  39.55 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  36.5 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  55 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  37.78 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  37.5 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  36.36 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  37.32 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.21 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.62 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  39.86 
 
 
283 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  57.14 
 
 
296 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  49.32 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  34.69 
 
 
315 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  37.12 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.87 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  37.14 
 
 
298 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
298 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35.62 
 
 
294 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
300 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
298 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>