208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2072 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  100 
 
 
149 aa  291  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  49.65 
 
 
147 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  53.38 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  48.91 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 
159 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  37.59 
 
 
143 aa  84.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  38.93 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  40.97 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  38.3 
 
 
293 aa  67.8  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  40 
 
 
183 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  33.82 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.41 
 
 
310 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.99 
 
 
308 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  40.88 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  40.88 
 
 
303 aa  61.6  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  36 
 
 
317 aa  60.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  35.67 
 
 
305 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
296 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  35.92 
 
 
305 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  34.69 
 
 
324 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  38.85 
 
 
192 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
296 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
295 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 
300 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  31.72 
 
 
322 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  33.11 
 
 
299 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.03 
 
 
294 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
294 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 
294 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 
297 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  34.69 
 
 
155 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.79 
 
 
315 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  34.25 
 
 
155 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
155 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
155 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 
289 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  28.77 
 
 
151 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  33.58 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
293 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  35 
 
 
294 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.57 
 
 
295 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
295 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
295 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  34.69 
 
 
305 aa  50.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
343 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.37 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  35.04 
 
 
300 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  37.59 
 
 
288 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  62.79 
 
 
277 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  34.97 
 
 
309 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.36 
 
 
292 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
292 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  34.53 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  32.39 
 
 
348 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.89 
 
 
303 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.76 
 
 
294 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.5 
 
 
345 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.33 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  31.79 
 
 
321 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
292 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
274 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 
288 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  29.08 
 
 
341 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1920  UspA domain protein  35.14 
 
 
292 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.812524  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.41 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
289 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  32.08 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  32.68 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  32.68 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  32.68 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  32.68 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
277 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
296 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32.68 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
275 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  35.56 
 
 
292 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
316 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
145 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  27.74 
 
 
294 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34.97 
 
 
298 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
294 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
298 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
298 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>