129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1902 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  312  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  39.73 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  36.03 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  36.5 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  37.88 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  36.03 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2137  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.221576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.73 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  32.59 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  37.14 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  40.13 
 
 		 324 aa  57.4  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  33.08 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  38.06 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2140  hypothetical protein  36.73 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  37.5 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.27 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  40 
 
 		 284 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.24 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  37.91 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 275 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 275 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 288 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1638  UspA domain protein  36.99 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170116  normal  0.0161914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.81 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 246 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 287 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  32.85 
 
 		 287 aa  52.4  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.77 
 
 		 317 aa  52  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  37.07 
 
 		 295 aa  51.6  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 290 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  35.21 
 
 		 292 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  32.12 
 
 		 315 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 289 aa  50.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  37.09 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1014  UspA domain protein  35.82 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1869  UspA domain-containing protein  38.05 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.25 
 
 		 321 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  32.64 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  35.17 
 
 		 305 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  37.8 
 
 		 381 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  26.9 
 
 		 341 aa  48.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.36 
 
 		 308 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  37.86 
 
 		 294 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 296 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 294 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 294 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  38.05 
 
 		 290 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  29.33 
 
 		 291 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  33.79 
 
 		 305 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  30.41 
 
 		 302 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  26.9 
 
 		 345 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  31.86 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  31.17 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  33.06 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 296 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  35.4 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  32.67 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4100  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141571  normal  0.294645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  31.65 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.59 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  37.59 
 
 		 310 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0344  UspA domain-containing protein  38.39 
 
 		 284 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 297 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 292 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  35.51 
 
 		 295 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 289 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 297 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18580  universal stress protein UspA-like protein  33.57 
 
 		 272 aa  44.3  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  37.39 
 
 		 295 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 296 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 138 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.07 
 
 		 306 aa  44.3  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  30.34 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  34.48 
 
 		 302 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  42.25 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  30.66 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  34.82 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2071  UspA domain protein  34.31 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000068593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  30.66 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  32.35 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.45 
 
 		 341 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>