More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6234 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  59.87 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  55.37 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  50.63 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  51.27 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  51.27 
 
 		 315 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  51.27 
 
 		 315 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  50.33 
 
 		 318 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  46.45 
 
 		 317 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5604  UspA domain protein  45.76 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  44.82 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  42.16 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  42.16 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  40.92 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  40.92 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  41.37 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  40.69 
 
 		 168 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  36.99 
 
 		 151 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  36.99 
 
 		 151 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  38.46 
 
 		 187 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  35.17 
 
 		 168 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.62 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.19 
 
 		 164 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.87 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.92 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  35.21 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  36.05 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 158 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 159 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  30.82 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.08 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  35.86 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34.25 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.73 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.76 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  35.17 
 
 		 155 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  35.17 
 
 		 155 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 163 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  35.17 
 
 		 155 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  35.17 
 
 		 155 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32.41 
 
 		 155 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.65 
 
 		 149 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  35.17 
 
 		 155 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  40.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  40.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  40.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  40.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  34.93 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.21 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  34.93 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  40.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 157 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  40.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.1 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  35.17 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  30.82 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  33.78 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  36.81 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  29.66 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.63 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  36.55 
 
 		 166 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 144 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  31.9 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  26.58 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 157 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  34.51 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  35.86 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  35.86 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  33.56 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.43 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  24.36 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.06 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  25.45 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  25.45 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  32.41 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  32.41 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.28 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.41 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  34.25 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  34.25 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>