More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 149 aa  285  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  39.71 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  40.15 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  39.73 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.29 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  34.31 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  32.33 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  35.77 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.14 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  38.52 
 
 		 273 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  36.57 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  38.85 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  35.71 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.43 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2072  UspA domain protein  33.33 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000584159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  34.27 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  31.94 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  36.42 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.01 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.94 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.87 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.66 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  31.37 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  31.21 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  30.72 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  31.21 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  30.72 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  31.37 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.91 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.85 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  30.72 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  30.72 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  30.72 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 292 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 290 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 		 296 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  30.97 
 
 		 302 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  31.91 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.08 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  31.51 
 
 		 313 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 294 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  35.62 
 
 		 290 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 297 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32 
 
 		 288 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.58 
 
 		 284 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.78 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  48.28 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.57 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  33.99 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.99 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32.72 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.99 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  32.86 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.45 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 289 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 293 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  29.29 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  31.01 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  34.51 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 288 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  36.49 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.28 
 
 		 345 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 276 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30.14 
 
 		 294 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  30.19 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.16 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  28.67 
 
 		 347 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 294 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 		 275 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.51 
 
 		 288 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  30.57 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.11 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>