More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0804 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  100 
 
 
138 aa  266  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  50.72 
 
 
138 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  47.45 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  41.13 
 
 
140 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  40.74 
 
 
147 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  42.25 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  38.85 
 
 
147 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  39.16 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  39.58 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  39.86 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.19 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  40.13 
 
 
314 aa  82  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  38.46 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  41.73 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  39.86 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  37.14 
 
 
297 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.55 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.71 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  39.72 
 
 
296 aa  77  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.51 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  37.86 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.21 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  37.41 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  39.42 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  37.5 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  38.1 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  38.1 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  36.36 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.43 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  38.36 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.86 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.01 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  44.2 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  35.97 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  35.46 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  30.97 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
274 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  36.88 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  34.75 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  43.88 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.14 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.49 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.49 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  38.36 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  34.78 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  38.03 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  32.35 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.72 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  34.03 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  35.97 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  36.43 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  35.71 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.29 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.3 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  34.84 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  38.19 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.17 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  36.91 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  37.16 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  36.96 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.43 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  32.62 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  36.69 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  33.1 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  37.59 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>