More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0271 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  36.05 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  39.01 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  36.99 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  34.48 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.55 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  37.33 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.94 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.37 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 145 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 156 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.01 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.94 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  31.85 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.39 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 156 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 171 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 138 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  34.44 
 
 		 156 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  37.84 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 156 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  38.1 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  36.6 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.03 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.92 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  32.43 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  32.43 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.05 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  36.17 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.87 
 
 		 150 aa  62  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.33 
 
 		 168 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.37 
 
 		 143 aa  62  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.51 
 
 		 147 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.08 
 
 		 154 aa  62  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  31.13 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.75 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  32.21 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.01 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.61 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.21 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.56 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  31.03 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.73 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  29.41 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.8 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.1 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  30 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  31.76 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  33.33 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.55 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.21 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.01 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  32.43 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  31.93 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  29.41 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  32.19 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  32.39 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  32.89 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>