More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1279 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  309  9e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  43.97 
 
 
291 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  44.9 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  42.25 
 
 
304 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  40.38 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  42.41 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  41.22 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  34.42 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.17 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  42 
 
 
317 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  37.16 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  35.62 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  42.95 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  38.03 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  40.56 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.86 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  40.85 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  43.24 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  40.15 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  36.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  40 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  40.56 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  40.54 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.81 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  35.71 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  36.55 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  36.55 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  36.55 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  36.55 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.36 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  39.57 
 
 
297 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  36.55 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  35 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40.54 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  34.21 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  39.07 
 
 
280 aa  70.9  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  35.86 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  34.69 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  37.59 
 
 
212 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  35 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  35 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  35 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  35 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  34.72 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  35 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  33.73 
 
 
515 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  35 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  35 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  35.57 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.93 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  35.81 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  39.16 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.96 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  34.29 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.17 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.93 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  35.86 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.93 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  35.86 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  34.93 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  35.17 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.72 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  33.57 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  33.57 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.89 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  36.36 
 
 
306 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.64 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  34.93 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  34.97 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  33.11 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  35.29 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>