More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2401 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  276  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  36.88 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  38.13 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.3 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.8 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  37.09 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.72 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  35.66 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.53 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.37 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  36.17 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  32.86 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  32.87 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  34.03 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.23 
 
 		 290 aa  67  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 297 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  34.51 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.62 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  32.17 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  29.66 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.46 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.17 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  31.39 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  33.33 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  33.33 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  35.71 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  30.77 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.57 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  35.42 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.65 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.53 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  32.62 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  32.67 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  33.55 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  33.55 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  32.67 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  32.41 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.58 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.71 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.46 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.09 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 291 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.94 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.76 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.79 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.27 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  35.25 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  33.79 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  32.62 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.37 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.09 
 
 		 415 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.79 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.91 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.69 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  30.77 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.57 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>