More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2705 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  100 
 
 
151 aa  307  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  100 
 
 
151 aa  307  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  81.46 
 
 
151 aa  259  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  80.13 
 
 
151 aa  256  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  77.48 
 
 
151 aa  236  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  68.21 
 
 
151 aa  213  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  36.05 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.97 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  37.5 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  37.5 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.99 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.77 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.44 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.86 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  35.06 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.93 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  33.77 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  33.77 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.01 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.84 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.33 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.77 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  33.77 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.93 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  33.11 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  31.29 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.1 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.26 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.08 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  28.67 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.62 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  35.83 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  31.29 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  28.67 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  28.67 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  37.91 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  28.67 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  28.67 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  28.67 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.41 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  36.36 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  30.46 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  32.64 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.97 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  31.95 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  30.52 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.19 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  41.67 
 
 
217 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  28.67 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  28 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.48 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.65 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.58 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.79 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  28 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  31.94 
 
 
165 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.82 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.24 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.64 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.94 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  34.67 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  35.1 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  32.08 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  33.79 
 
 
339 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.97 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  28.1 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  30.07 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.33 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  30.07 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  30.07 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>