More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3101 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  100 
 
 
151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  68.21 
 
 
151 aa  224  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  68.21 
 
 
151 aa  213  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  68.21 
 
 
151 aa  213  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  64.9 
 
 
151 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  66.89 
 
 
151 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.41 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.54 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.26 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.76 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.76 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.45 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  34.93 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  30.52 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.1 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  34 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.8 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.33 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  30.97 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.17 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.99 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  30.34 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  29.25 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.19 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  30.61 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  33.1 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  31.79 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.97 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  33.11 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.61 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  36.89 
 
 
217 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  28.48 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  28.48 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  31.33 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  25.85 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  32.69 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.79 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  29.41 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.73 
 
 
207 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.56 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  29.33 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  33.56 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.23 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  32.67 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  25.85 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  25.85 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  30.06 
 
 
515 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  25.85 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  25.85 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.89 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  25.85 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.66 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.43 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.41 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  33.56 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  48.33 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  32.19 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  28.67 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.41 
 
 
297 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  35.14 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  29.73 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.93 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.72 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  35.06 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  25.85 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  32.03 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  25.17 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.57 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  25.17 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  31.18 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.47 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  31.29 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.29 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>