More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2335 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  100 
 
 
147 aa  295  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  64.14 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.88 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.1 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  33.55 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  35.62 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  35.62 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  36.36 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  36.36 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  37.16 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.81 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  33.11 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  35.37 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  34.69 
 
 
300 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  30.34 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  46.67 
 
 
287 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  29.49 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.1 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.79 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  30.07 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  37.41 
 
 
297 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  30.2 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  29.61 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  33.33 
 
 
192 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.46 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  33.57 
 
 
280 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  33.78 
 
 
303 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  28.87 
 
 
281 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  32.03 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  38.17 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  32.26 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  52.83 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.01 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.64 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  32.21 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.46 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.41 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.76 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 
293 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.56 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  39.76 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  46.38 
 
 
309 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  38.95 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  30.32 
 
 
310 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.56 
 
 
299 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  34.21 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  34.29 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  36.9 
 
 
180 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.47 
 
 
284 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  45.9 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  32 
 
 
295 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.49 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.47 
 
 
288 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  30.32 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
311 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.44 
 
 
291 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  39.51 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5215  UspA domain protein  38.71 
 
 
284 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  37.65 
 
 
290 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  29.17 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  29.17 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  29.61 
 
 
315 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.89 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  35.62 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.28 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  30.82 
 
 
147 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  34.97 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  47.17 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  28.47 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  46.67 
 
 
311 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  47.17 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  33.98 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  37.5 
 
 
158 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  32.67 
 
 
302 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  33.98 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  27.63 
 
 
294 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  34.39 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.39 
 
 
155 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
294 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  26.76 
 
 
281 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  30.47 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  40.3 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  43.1 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  45.9 
 
 
162 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>