More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0155 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  345  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  34.31 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0018  UspA domain protein  36.17 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.11 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  37.01 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.33 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.58 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
306 aa  68.6  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  30.77 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  30.77 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.26 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.53 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.53 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  33.56 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.79 
 
 
290 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
274 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  34.46 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.67 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
143 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.13 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.88 
 
 
153 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.88 
 
 
153 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  45.21 
 
 
288 aa  60.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  33.95 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  30.33 
 
 
130 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  34.23 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  33.77 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  45.59 
 
 
515 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
141 aa  58.9  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.07 
 
 
287 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  50 
 
 
148 aa  58.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.43 
 
 
144 aa  58.2  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  34.67 
 
 
311 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
144 aa  58.2  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38 
 
 
288 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  30 
 
 
157 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  38.17 
 
 
147 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  38.55 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.71 
 
 
295 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  54.72 
 
 
304 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  32.47 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.48 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.67 
 
 
142 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.48 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.67 
 
 
284 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  31.76 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  31.21 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  28 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.21 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  32.85 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  34.93 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  34.46 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.14 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.53 
 
 
150 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  33.78 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.17 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
144 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  30.46 
 
 
151 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  28.78 
 
 
140 aa  55.1  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  32.24 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  44.83 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  29.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  40.96 
 
 
138 aa  55.1  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
143 aa  54.7  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 
143 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  31.33 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  32.76 
 
 
305 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  31.33 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.33 
 
 
150 aa  54.3  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
137 aa  54.3  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  31.87 
 
 
294 aa  54.3  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  29.53 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  31.97 
 
 
305 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  32.45 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  43.06 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.46 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
282 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.27 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.76 
 
 
289 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  33.04 
 
 
307 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.45 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>