More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1238 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  100 
 
 
310 aa  593  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  37.91 
 
 
308 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  30.16 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  31.67 
 
 
320 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  34.42 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.75 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.13 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  32.19 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.33 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.37 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  31.58 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  29.87 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  26.46 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.27 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  30.71 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.45 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  32.09 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  30.65 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  32.26 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.22 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.21 
 
 
150 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  27.97 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  30.71 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.14 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  33.98 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.29 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.85 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  27.36 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
141 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  34.91 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  35.03 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  29.35 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  29.35 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.34 
 
 
289 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  29.35 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.58 
 
 
151 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.07 
 
 
149 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  29.25 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  36.11 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  28.7 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  28 
 
 
313 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 
289 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
292 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.1 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  33.82 
 
 
144 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  33.49 
 
 
291 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
151 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.79 
 
 
139 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  28.8 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  35.37 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  29.55 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.72 
 
 
153 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.1 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.17 
 
 
150 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  36.84 
 
 
155 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  31.89 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 
138 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  29.28 
 
 
341 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.11 
 
 
153 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.47 
 
 
157 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  28.95 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  36.96 
 
 
143 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  34.33 
 
 
147 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
293 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  31.67 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  30.29 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  30.28 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.61 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  27.65 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
159 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 
153 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  29.08 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  28.91 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>