52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12342 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  44.1 
 
 
320 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  41.3 
 
 
294 aa  228  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  44.41 
 
 
293 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
295 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  34.13 
 
 
302 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  30.51 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  34.12 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  28.91 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  26.85 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
295 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  25.51 
 
 
290 aa  79  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  26.46 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  31.53 
 
 
329 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.57 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.73 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  32.43 
 
 
136 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  23.47 
 
 
314 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  25.71 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.61 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  27.54 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.62 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.71 
 
 
139 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.13 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.73 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  26.62 
 
 
297 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  23.69 
 
 
415 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  29.77 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  25.81 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
140 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  24 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  29.07 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 
151 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  22.73 
 
 
130 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  32.86 
 
 
130 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.15 
 
 
148 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.1 
 
 
151 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  29.56 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  21.53 
 
 
149 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  28.19 
 
 
147 aa  42.7  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2630  UspA domain protein  28.93 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  28.47 
 
 
140 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.85 
 
 
165 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
160 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>