29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3791 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  100 
 
 		 294 aa  586  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  41.3 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  42.57 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  39.66 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  35.22 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  33.55 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  30.56 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  32.66 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  27.92 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  26.07 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  26.95 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  24.19 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  25.76 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  30.1 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  29.35 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  30.88 
 
 		 158 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.72 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.25 
 
 		 415 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.25 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  25.58 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.92 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  24.23 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>