52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5365 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  100 
 
 		 320 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  44.93 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  40.6 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  44.82 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  33.56 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  32.66 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  31.73 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  32.54 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  32.57 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  33 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  27.96 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  33 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  33 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  29.51 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  31.72 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  29.63 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  26.62 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  34.27 
 
 		 147 aa  53.5  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.74 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  28.51 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 160 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  30.67 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.08 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  25.91 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  30.5 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  22.22 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  26.61 
 
 		 170 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  27.67 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  23.29 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  30.43 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  28.43 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  26.64 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  26.64 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  26.64 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  25.86 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 145 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 157 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  31.25 
 
 		 156 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  25.93 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>