46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3093 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  48.81 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  45.02 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  44.67 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  44.67 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  38.62 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  40.75 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  39.18 
 
 		 290 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  30.51 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  31.31 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  33.9 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  31.53 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  31.36 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  38.66 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  34.18 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  33.1 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  30.79 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  30.79 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  30.79 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  32.03 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  25.74 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  26.7 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  26.7 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  25.22 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  30.43 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.46 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  28.64 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  32.82 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  25.17 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  26.39 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  34.75 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  23.34 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  26.09 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  28.64 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  24.44 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  30.28 
 
 		 146 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  28.14 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  28.14 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  24.91 
 
 		 415 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>