24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2015 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  100 
 
 		 329 aa  631  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  43.51 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  39.31 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 		 289 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  32.52 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  31.53 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  29.69 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  28.37 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  28.47 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  26.97 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  32.54 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  27.59 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  27.93 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  28.28 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  28.9 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  30.2 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  36.8 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>