45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1573 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  557  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  85.21 
 
 		 286 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  41.72 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  41.72 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  37.02 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  37.85 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4857  hypothetical protein  54.9 
 
 		 124 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.16769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  29.1 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  29.72 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  29.35 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  29.27 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  31.08 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  31.63 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  28.19 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  25.67 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  32.88 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.83 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  22.55 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  27.56 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  29 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  31.98 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  32.45 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  27.18 
 
 		 415 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  35 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  29.17 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  21.25 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  20.48 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  27.49 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.25 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  28.68 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  24.89 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  24.49 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.07 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  23.64 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  29.58 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.47 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>