51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1208 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  99.66 
 
 		 295 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  99.66 
 
 		 295 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  55.4 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  47.39 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  45.02 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  27.92 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  34.36 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  29.69 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  37.59 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  26.85 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  32.07 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  31.34 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  34.09 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  30.46 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  31.99 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.23 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4857  hypothetical protein  38.24 
 
 		 124 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.16769 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  29.25 
 
 		 415 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  25.93 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  35.92 
 
 		 142 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  29.47 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.83 
 
 		 155 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  31.03 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  25.35 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  23.88 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  26.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  31.72 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.21 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.48 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.49 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  31.03 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 145 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  31.13 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.68 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  29.91 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.94 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  25.83 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  28.26 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  30.15 
 
 		 142 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>