69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1938 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  100 
 
 		 290 aa  565  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  51.22 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  47.39 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  46.74 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  46.74 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  41.75 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  40.2 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  37.02 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  31.25 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  29.35 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  26.17 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  26.95 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  33.45 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  27.97 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  29.05 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  27.68 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  34.78 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.05 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  27.36 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.57 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.57 
 
 		 140 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  40.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  27.63 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.09 
 
 		 156 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  31.13 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  26.35 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  34.88 
 
 		 151 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4857  hypothetical protein  39.66 
 
 		 124 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.16769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.7 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  26.81 
 
 		 143 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  28.36 
 
 		 154 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  23.4 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  24.81 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 		 692 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  27.66 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  33.58 
 
 		 158 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  31.43 
 
 		 164 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  24.77 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  34.95 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  28.24 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  22.87 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  32.39 
 
 		 164 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.07 
 
 		 153 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  34.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  34.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  34.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 		 160 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  34.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  28.79 
 
 		 128 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2890  UspA domain-containing protein  30.89 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  34.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  34.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  34.95 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  25.98 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  32.39 
 
 		 164 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  39.62 
 
 		 130 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  25.59 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  37.5 
 
 		 142 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  24.6 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  32.04 
 
 		 144 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  42.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>