More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2500 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  100 
 
 
164 aa  320  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  95.12 
 
 
164 aa  309  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  87.2 
 
 
164 aa  288  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  57.75 
 
 
162 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  52.29 
 
 
156 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  53.79 
 
 
162 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  53.79 
 
 
162 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  50.7 
 
 
162 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  53.1 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  50.35 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  48.67 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2501  UspA domain protein  48.94 
 
 
156 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  44.44 
 
 
153 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  44.44 
 
 
153 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  43.75 
 
 
153 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2414  UspA domain protein  51.08 
 
 
156 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29637  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.91 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  42.76 
 
 
305 aa  88.2  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  37.66 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  38.16 
 
 
153 aa  84.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.73 
 
 
151 aa  84.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  38.31 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1446  universal stress protein UspA  47.55 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  36.31 
 
 
149 aa  84.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  38 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.89 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.93 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.93 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  34.42 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  36.05 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  38.78 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.42 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  41.18 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  40 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  45.14 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  40.44 
 
 
134 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  38.62 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  40.14 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.88 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.99 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.25 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  34.93 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.1 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  39.58 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.51 
 
 
304 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.48 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.76 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  35.14 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  34.9 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.42 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  27.78 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  33.79 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.84 
 
 
287 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  33.79 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.33 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  35.43 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  30.56 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  36.49 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.48 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.67 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.41 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.33 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.5 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  36.71 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  29.22 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.55 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  39.46 
 
 
311 aa  68.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  30.72 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  32.89 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.65 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.17 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.36 
 
 
305 aa  67.4  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  33.56 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.5 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35.9 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>