More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3112 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  49.82 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  48.42 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  31.94 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  28.05 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  29.23 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  26.64 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  29.25 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  26.44 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  29.72 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.7 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  24.75 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  31.03 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  24.24 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  28.82 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  34.04 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.46 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  24.32 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.04 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  24.32 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  25.51 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  28.23 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  27.05 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.57 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  27.07 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.68 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.23 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  25.71 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.17 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.62 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  24.76 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  25.66 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.79 
 
 		 149 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.17 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  22.95 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  25.64 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  19.68 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.16 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  30.05 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.53 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  31.85 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  24.38 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  27.27 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.51 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.33 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.29 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 		 128 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  25.67 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  29.15 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.42 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.91 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.66 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  25.33 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.06 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.18 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  27.62 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.5 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  26.96 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.55 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.79 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.79 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.14 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  20.96 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.46 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  27.09 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  24.67 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  27.66 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  23.1 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  27.86 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  32.39 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.66 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.82 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  28.99 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.34 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.85 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.85 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  24.1 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  27.66 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>