More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0384 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  42.57 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
145 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  37.32 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.24 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.33 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  33.97 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  36.36 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.89 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  34.03 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  34.48 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  35.1 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  37.16 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.91 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.24 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  34.25 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  33.57 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  37.5 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34.23 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.56 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.39 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  36.81 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  31.91 
 
 
282 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
274 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34.25 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.1 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  35.57 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.5 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  30 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.62 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.87 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.56 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  34.69 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  32.64 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.07 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  34.01 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  36 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  34.01 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  30.5 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.66 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.33 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.66 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.19 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  31.47 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.97 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  38.36 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.34 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.27 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.21 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.91 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.71 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.19 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  32.62 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.04 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  32.41 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.95 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  33.77 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.57 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  32 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
294 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.53 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  29.73 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.86 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  29.81 
 
 
515 aa  67.8  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  29.25 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  32.64 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  30.99 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  30.5 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.66 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>