90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1999 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  583  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  67.12 
 
 
292 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  67.12 
 
 
292 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  67.12 
 
 
292 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  33.9 
 
 
292 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  35.22 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  34.14 
 
 
320 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  33.89 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  32.66 
 
 
302 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
311 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
289 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 
286 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  30.38 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  29.63 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  29.62 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  31.53 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  30.48 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  32.75 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.35 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  29.38 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.73 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.26 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  29.03 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  24.76 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  26.57 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.88 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.57 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  25.21 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25 
 
 
415 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.24 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  22.9 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  41.76 
 
 
293 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  41.76 
 
 
293 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  24.17 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  24.15 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  22.44 
 
 
160 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  23.81 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  24.12 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  30.65 
 
 
302 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  39.56 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.35 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  25 
 
 
161 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  23.9 
 
 
297 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.85 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  26.9 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  24.18 
 
 
146 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  40 
 
 
130 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  28.17 
 
 
200 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  24.07 
 
 
290 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
162 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  27.78 
 
 
158 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  23.58 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.18 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  22.98 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.16 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.57 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  24.81 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  27.78 
 
 
160 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.47 
 
 
158 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.11 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  25.74 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  25.75 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  25.71 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  28.86 
 
 
158 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  25.6 
 
 
140 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  27.4 
 
 
147 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  28.74 
 
 
142 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.28 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.52 
 
 
143 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 
177 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  26.3 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.85 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  22.53 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  26.28 
 
 
140 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  22.41 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  25.68 
 
 
187 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 
145 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  45 
 
 
167 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  37.08 
 
 
152 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  25.25 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.76 
 
 
154 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  37.5 
 
 
146 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>