More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1831 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  100 
 
 		 167 aa  344  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  33.33 
 
 		 167 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  33.12 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  33.12 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  33.74 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  33.12 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  30.57 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.68 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  30.63 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  29.31 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.85 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.95 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.68 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  31.48 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  26.9 
 
 		 515 aa  64.3  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.03 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  29.65 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  32.1 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.49 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.56 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  29.68 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.32 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.48 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  28.66 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26.99 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  26.4 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.57 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  27.49 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  27.56 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.83 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  27.27 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  29.87 
 
 		 271 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.76 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.76 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  28.93 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.08 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  29.7 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  29.45 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.61 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  31.25 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.01 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  23.87 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  27.67 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30.67 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.11 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.76 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  30.36 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  41.1 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  31.01 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.1 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.19 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  44.07 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  28.66 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  29.27 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.93 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  28.57 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.41 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.45 
 
 		 276 aa  54.3  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.21 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  33.12 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.25 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  31.29 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  42.86 
 
 		 294 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.3 
 
 		 415 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  28.12 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.22 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  36.67 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 297 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.06 
 
 		 297 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  25.16 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  27.98 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.41 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.3 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  25.16 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  26.97 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>