More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1407 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  100 
 
 		 161 aa  328  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  37.11 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  32.28 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  32.28 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  30.13 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  27.85 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  28.03 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  37.13 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  27.39 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  35.85 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.67 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.87 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.08 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.68 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  30.63 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.17 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.94 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  32.69 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  28.22 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.41 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.08 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  27.63 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.37 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.17 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.82 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.49 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.75 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.11 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.17 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.58 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.25 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.11 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  27.61 
 
 		 515 aa  68.2  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.48 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.48 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.49 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.03 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 300 aa  67.4  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.01 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.3 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  31.82 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  32.12 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.81 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.92 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.3 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.03 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.45 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.03 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.85 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.56 
 
 		 288 aa  64.7  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  30.3 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  25.48 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.39 
 
 		 290 aa  63.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  28.22 
 
 		 277 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.26 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.49 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  29.68 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  32.24 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  30.32 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.52 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  33.97 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  28.21 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  30.66 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  26.25 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.19 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.75 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.22 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.61 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  32.84 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  32.69 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  28.21 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  32.69 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  28.67 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>