More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1925 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  285  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.49 
 
 
187 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.81 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  36 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.33 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  34.72 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  34.69 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  34.69 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  34.67 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
155 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  33.8 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  33.8 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  37.41 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  39.6 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  37.5 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  34.69 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  34 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  34 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  34 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  39.46 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  35.42 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  39.73 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  34 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  36.3 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  33.56 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  34.93 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  35.17 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  34.03 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.34 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  37.33 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.23 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  32.64 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.1 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.19 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  37.16 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.42 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.03 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  34.01 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.72 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.46 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  35.44 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  37.93 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.19 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  29.38 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.78 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  35.95 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  32.17 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36.05 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36.05 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  30.34 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.29 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  30.34 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3779  UspA domain protein  31.51 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.46 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0898  UspA domain protein  38.62 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.36 
 
 
300 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0751  universal stress family protein  38.62 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.27 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.72 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.57 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  34.03 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.55 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  35.57 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  31.82 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.55 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  33.77 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.07 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  34.9 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.87 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  37.96 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.41 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  29.8 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>