More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1661 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  308  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  95.24 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  73.29 
 
 		 147 aa  235  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  62.07 
 
 		 149 aa  207  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  63.45 
 
 		 149 aa  206  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  62.33 
 
 		 151 aa  200  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  64.38 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  56.85 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  43.45 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  42.07 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  41.38 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  39.31 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.67 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  37.24 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 160 aa  93.6  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  37.14 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  35.86 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  36.91 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 308 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  37.5 
 
 		 320 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.06 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.23 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  38.19 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  34.53 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.25 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  33.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.57 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  33.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  38 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.57 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.97 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  34.42 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  33.1 
 
 		 287 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.65 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.65 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.03 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  34.42 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  33.09 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.36 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 308 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  33.1 
 
 		 305 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  32.39 
 
 		 307 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.72 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.39 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.3 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.87 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  32.45 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.87 
 
 		 290 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  32.41 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  30.34 
 
 		 304 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.65 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.64 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  32.41 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  32.08 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.81 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.19 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  31.16 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.69 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.87 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.07 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  31.72 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  33.33 
 
 		 305 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.28 
 
 		 288 aa  73.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.99 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  33.33 
 
 		 288 aa  73.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  31.94 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.68 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.27 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>