More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3355 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  71.33 
 
 		 143 aa  226  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  72.73 
 
 		 143 aa  224  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  73.43 
 
 		 143 aa  223  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  67.83 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  69.23 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  69.23 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  69.23 
 
 		 143 aa  214  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  67.13 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  67.13 
 
 		 143 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  67.13 
 
 		 143 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  67.13 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  66.43 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  66.43 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  66.43 
 
 		 143 aa  203  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  62.94 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  63.64 
 
 		 143 aa  198  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  60.14 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  54.55 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  58.5 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  57.14 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  50.34 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  45.58 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  45.58 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  45.58 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  45.58 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  44.9 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  35.86 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  35.86 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.81 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  37.59 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.09 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.55 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.17 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.43 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.17 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.17 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  38.19 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  35.21 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.8 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  38.46 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.33 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.67 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  33.1 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.81 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.11 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.11 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  34.21 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  30.82 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  31.21 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  29.79 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  33.78 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30.82 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.34 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.94 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.34 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.66 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.93 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  29.41 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  29.41 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  30.71 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.78 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.29 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  28.97 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  27.14 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  29.05 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  27.46 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  30.61 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.08 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  26.24 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.1 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.66 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.21 
 
 		 276 aa  63.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.79 
 
 		 288 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.19 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  29.8 
 
 		 169 aa  62  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>