More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0976 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  75.52 
 
 		 143 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  74.13 
 
 		 143 aa  225  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  74.13 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  74.13 
 
 		 143 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  74.13 
 
 		 143 aa  223  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  73.43 
 
 		 143 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  73.43 
 
 		 143 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  72.73 
 
 		 143 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  73.43 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  73.43 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  73.43 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  67.83 
 
 		 143 aa  213  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  71.33 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  66.43 
 
 		 143 aa  203  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  67.13 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  67.83 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  55.24 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  53.85 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  46.48 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  46.94 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  46.94 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  39.47 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.5 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.21 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.17 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.43 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  38.3 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.43 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.09 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.37 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.43 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  36.88 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  35.66 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  35.66 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  35.21 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  32.86 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.76 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  30.94 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  31.21 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.46 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.62 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  29.58 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 285 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.19 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.19 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  30 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  34.27 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  34.25 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.25 
 
 		 304 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.28 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.58 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.28 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.19 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  25.36 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  32.87 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  35.17 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.71 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.8 
 
 		 284 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.19 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.1 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.56 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  30.07 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  29.45 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.86 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.87 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.5 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.99 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3779  UspA domain protein  27.59 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.14 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  29.71 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  31.25 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.29 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  26.81 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  28.37 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.61 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>