More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1569 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  80.95 
 
 		 147 aa  248  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  70.75 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  65.31 
 
 		 147 aa  206  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  61.9 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  58.5 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  55.78 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  55.78 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  52.38 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 		 143 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  51.7 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  51.02 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  51.7 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  51.02 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  46.94 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  45.58 
 
 		 143 aa  137  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  41.03 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  37.84 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.84 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.81 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.49 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.08 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.76 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.14 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  25.35 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.94 
 
 		 320 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.37 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.8 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  28.67 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.37 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.37 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.81 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.34 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  29.37 
 
 		 154 aa  67  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.97 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  28.86 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  28.67 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.17 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  33.79 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.94 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  31.76 
 
 		 276 aa  64.7  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.37 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  28.77 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  30.46 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  29.61 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  30.46 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.72 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  28.86 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  29.61 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.08 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.08 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.56 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  30.56 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.94 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  29.37 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30.56 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  29.37 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  27.89 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  31.08 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  27.46 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  31.08 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  31.08 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.21 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.29 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.07 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  28.57 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  28.77 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  30.56 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  27.59 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.34 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  24.31 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.45 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  28.67 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>