More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1010 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  100 
 
 		 145 aa  298  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  79.87 
 
 		 149 aa  248  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  79.19 
 
 		 149 aa  247  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  77.85 
 
 		 149 aa  245  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  78.77 
 
 		 146 aa  220  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  50.34 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  45.58 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  47.62 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  46.26 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  46.94 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  44.9 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  46.94 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  46.94 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  44.59 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  44.9 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  35.26 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.11 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  34.87 
 
 		 314 aa  77.4  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.45 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.8 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.29 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.77 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.8 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.81 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.45 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.82 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  24.34 
 
 		 155 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  28.95 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.57 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.92 
 
 		 304 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  31.82 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.81 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  31.82 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  28.19 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.9 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.9 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.78 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.05 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  29.45 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.05 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  27.89 
 
 		 282 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.51 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  26 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  25.33 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  28.28 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.67 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.67 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  28.08 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2106  UspA domain protein  23.33 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  28.92 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  30.41 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32.62 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2112  UspA domain protein  24.67 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  28.19 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  30.41 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  34.44 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  24.31 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  28.08 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  25.62 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  27.15 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  26.85 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  27.7 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  27.22 
 
 		 168 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.08 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 449 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  26.85 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  27.15 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.67 
 
 		 288 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  29.41 
 
 		 296 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>