More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3354 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  61.9 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  63.27 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  60.54 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  57.82 
 
 		 147 aa  176  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  55.78 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  55.78 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  51.02 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  53.74 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  53.06 
 
 		 143 aa  157  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  48.3 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  52.38 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  49.66 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  48.98 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  46.94 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  48.3 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.88 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.69 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.39 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.69 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.05 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.03 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.33 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  32.65 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  34.72 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.58 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.33 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  29.25 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.72 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.77 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.03 
 
 		 304 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.37 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.37 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.37 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.43 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  28.28 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.34 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.65 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  29.17 
 
 		 153 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  29.37 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.11 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  28.97 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  32.41 
 
 		 306 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.28 
 
 		 314 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  31.25 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  32.65 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.87 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.43 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.57 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  31.94 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.67 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.67 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 449 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  29.86 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.03 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  32.88 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  30.61 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.66 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  31.03 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.89 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  27.08 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.51 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  29.86 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  29.37 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.34 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>