More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1662 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  100 
 
 		 146 aa  302  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  58.16 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  58.16 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  37.65 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  39.33 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  39.33 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.93 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  38.46 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.93 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  40.69 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  39.33 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  33.11 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.87 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.92 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  34.75 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.7 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.33 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  36.96 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.89 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.39 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.87 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.03 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.88 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  36.03 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.8 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  34.64 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.14 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.29 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.72 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  34.03 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  33.81 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.25 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  29.58 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  36.55 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.53 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.86 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.56 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.82 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.82 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 297 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.65 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  33.56 
 
 		 157 aa  67  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.17 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  27.92 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  32.87 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.81 
 
 		 154 aa  66.6  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.84 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.57 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.43 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  31.97 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  31.94 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  49.21 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  29.5 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.86 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.34 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  30.82 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  33.1 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.69 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.77 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  31.43 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  39.29 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.94 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  31.58 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.9 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.45 
 
 		 297 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.09 
 
 		 290 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>