More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0692 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.9 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.45 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.97 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.24 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.03 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.39 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.77 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.21 
 
 		 288 aa  68.2  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  27.92 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  29.68 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.27 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  30.07 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.41 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.58 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  30.07 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  29.94 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  29.27 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 285 aa  63.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 294 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.88 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  29.68 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  24.36 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.45 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  24.36 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  27.74 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.53 
 
 		 281 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  29.14 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  24.18 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.41 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.92 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  29.41 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.13 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  27.74 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  29.88 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.95 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.85 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  36.78 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  26.88 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.58 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  29.68 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  28.39 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.03 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  28.67 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  24.03 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  24.56 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  33.71 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  31.85 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  28.1 
 
 		 281 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  28.75 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  28.48 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  29.56 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.22 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  27.81 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.85 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  25.16 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  28.75 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.45 
 
 		 305 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  31.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  28.39 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  31.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  27.16 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  30.67 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  31.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  31.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  31.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  31.17 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  27.16 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  31.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  31.82 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  28.66 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  26.09 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  29.22 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>