More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1677 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  304  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  75.33 
 
 
150 aa  235  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  66.67 
 
 
150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  48.63 
 
 
162 aa  156  9e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  50.69 
 
 
152 aa  153  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  51.37 
 
 
162 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  50 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  49.31 
 
 
152 aa  150  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  49.31 
 
 
152 aa  150  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  49.31 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  49.31 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  49.31 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  49.31 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  49.31 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  49.31 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  49.31 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  48.63 
 
 
148 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  49.66 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  48.61 
 
 
145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  47.95 
 
 
147 aa  140  8e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  47.95 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  43.57 
 
 
166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  43.57 
 
 
166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  43.57 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
155 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
165 aa  99.4  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.33 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  31.91 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  35.92 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.67 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  34.27 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.41 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.37 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.05 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  33.1 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  29.87 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.14 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.67 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.14 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.99 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.93 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  29.09 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  27.03 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.28 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  28.48 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.03 
 
 
303 aa  68.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.68 
 
 
291 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.1 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  30.87 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.21 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  28.57 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.21 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  30.87 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.86 
 
 
290 aa  66.6  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  30.77 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.38 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  29.61 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.58 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.94 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  28.75 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.56 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.9 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.86 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.03 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.1 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.14 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.22 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.1 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.51 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.71 
 
 
280 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.34 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.87 
 
 
305 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.51 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.61 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  27.78 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  31.97 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1794  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.97 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>