More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3714 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  100 
 
 		 143 aa  298  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  78.32 
 
 		 143 aa  238  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  76.92 
 
 		 143 aa  230  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  74.83 
 
 		 143 aa  227  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  74.83 
 
 		 143 aa  227  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  74.83 
 
 		 143 aa  227  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  74.13 
 
 		 143 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  74.13 
 
 		 143 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  72.73 
 
 		 143 aa  224  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  76.92 
 
 		 143 aa  225  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  73.43 
 
 		 143 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  73.43 
 
 		 143 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  69.23 
 
 		 143 aa  216  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  69.23 
 
 		 143 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  67.83 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  62.94 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  62.94 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  60.84 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  59.44 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  57.82 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  55.78 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  57.14 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  157  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  52.03 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  51.35 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  44.9 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  44.9 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  42.11 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  36.43 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.27 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.81 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  36.43 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  37.14 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.72 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  39.04 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  38.51 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  36.62 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.25 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.14 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  37.76 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.42 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.8 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  34.97 
 
 		 306 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  37.41 
 
 		 320 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  33.09 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  36.17 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.1 
 
 		 288 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.42 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.57 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.99 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  38.19 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.91 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.94 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.94 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.33 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.81 
 
 		 304 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.86 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.69 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  33.33 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  32.39 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.21 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.45 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.14 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.82 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.14 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.39 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.93 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.13 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  30.5 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.37 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.64 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.62 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  29.45 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.51 
 
 		 300 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.51 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.79 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  36.36 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  29.45 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  30.82 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.43 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  27.7 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.25 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.87 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.64 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.78 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>