More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1641 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  29.39 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.05 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.49 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  28.08 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.3 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.1 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  26.64 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.68 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  27.45 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  24.83 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  26.26 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 157 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  27.55 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.25 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.42 
 
 		 449 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.34 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.15 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.84 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  25.77 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  26.6 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.87 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  29.01 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  28.93 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.99 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  28.52 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.91 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  25.94 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  28.3 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  27.74 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  27.64 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  27.65 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.86 
 
 		 142 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  30.28 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  26.69 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  25.68 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  27.64 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  28.57 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  25.58 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  26.97 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  28.29 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  23.71 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  24.67 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  29.63 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  30.93 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  24.34 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  26.64 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  23.26 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.25 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 153 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  27.83 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.26 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.84 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.27 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  26.9 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  30.4 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  24.67 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  22.76 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.14 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  26.07 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.46 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.62 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  23.95 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  25 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.28 
 
 		 149 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.5 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.37 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  25.08 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  25 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.43 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  25.81 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.21 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.5 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.7 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  36.21 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.54 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  33.1 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  26.14 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  30.88 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  21.15 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.94 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>