More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3798 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  100 
 
 
281 aa  545  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  39.45 
 
 
301 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.86 
 
 
300 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.15 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.47 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.1 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.1 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.96 
 
 
307 aa  92.8  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  32.42 
 
 
415 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.36 
 
 
297 aa  89  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  29.69 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.67 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.85 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.49 
 
 
281 aa  79  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.26 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  35 
 
 
144 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.34 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.14 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  32.31 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.25 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.15 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  34.33 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  37.59 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
145 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.97 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  41.04 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  28.87 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  28.39 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  40.46 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  36.36 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.07 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  33.8 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.16 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  38.81 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.74 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.77 
 
 
150 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 
145 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.43 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  33.33 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  33.33 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  35.56 
 
 
208 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  26.85 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.15 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.78 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.59 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.57 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  32.14 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.1 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  30.81 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  28.72 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  31.21 
 
 
148 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.07 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
158 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.06 
 
 
149 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.61 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  28.71 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.23 
 
 
152 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.08 
 
 
150 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 
288 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
145 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.5 
 
 
164 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.54 
 
 
149 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35 
 
 
147 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 
300 aa  62.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  26.06 
 
 
303 aa  62.4  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.73 
 
 
274 aa  62.4  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  33.33 
 
 
165 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
163 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  27.36 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  29.33 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  38.24 
 
 
151 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  33.8 
 
 
147 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  38.46 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  28.89 
 
 
140 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  29.62 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  37.5 
 
 
141 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  25.52 
 
 
151 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  33.82 
 
 
167 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.88 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  32.65 
 
 
187 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  27.45 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  26.1 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  26.01 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  28.89 
 
 
140 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  28.89 
 
 
140 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>