More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0923 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  33.45 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  36.21 
 
 
284 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  29.39 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  32.88 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  29.54 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  30.63 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.01 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.28 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  27.68 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.43 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.19 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  25.25 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  27.93 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  24.58 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  24.58 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  27.49 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.66 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  25.25 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.17 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.65 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  25.08 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.92 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  25.41 
 
 
390 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  26.4 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  22.88 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  27.24 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.33 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.91 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.28 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  26.07 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  26.89 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  23.44 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  33.99 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  27.8 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  27.13 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.03 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.09 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  28.19 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.62 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28 
 
 
297 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.66 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  25.24 
 
 
449 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  29.82 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.01 
 
 
156 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  27.99 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.7 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  26.58 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.39 
 
 
149 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.12 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.55 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
147 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 
324 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  36.5 
 
 
140 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.24 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.61 
 
 
151 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  26.91 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.68 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  28.27 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.28 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  26.22 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  25.33 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.94 
 
 
147 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  32.62 
 
 
148 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  29.66 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
149 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
157 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  26.73 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  27.27 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.37 
 
 
140 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
145 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  26.76 
 
 
282 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  32.62 
 
 
143 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.21 
 
 
156 aa  55.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  31.43 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30 
 
 
140 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.03 
 
 
152 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  20.28 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  25.76 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  28.48 
 
 
162 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2377  UspA domain protein  24.14 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  26.44 
 
 
180 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
147 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  26.01 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
143 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  24.47 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>