More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3085 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  586  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  56.85 
 
 
152 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  37.5 
 
 
300 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  37.83 
 
 
297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  49.33 
 
 
151 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  34.46 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  34.22 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
288 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  36.84 
 
 
317 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.32 
 
 
320 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 
291 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  51.01 
 
 
149 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  36.13 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.6 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  31.8 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.56 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.83 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.07 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  36.32 
 
 
282 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.28 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.57 
 
 
280 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  27.36 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.07 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  25.33 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  31.77 
 
 
309 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  38.51 
 
 
164 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  38.66 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.23 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.72 
 
 
295 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.1 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  36.04 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  35.55 
 
 
325 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  31.72 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  38.14 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  38.14 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.98 
 
 
309 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.45 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  29.97 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  23.26 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  30.23 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  35.17 
 
 
148 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  29.65 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  42.07 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.07 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.9 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  34.69 
 
 
149 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.25 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  37.24 
 
 
148 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  27.32 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  31.03 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  27.01 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  34.15 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  29.77 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  33.66 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  29.73 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.23 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  31.91 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.09 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.13 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.55 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  32.78 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  29.34 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 
297 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.38 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  36.05 
 
 
166 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  40 
 
 
150 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.07 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34 
 
 
147 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  37.06 
 
 
154 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
166 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  30.88 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  40.14 
 
 
140 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
166 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  42.18 
 
 
161 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  40.14 
 
 
140 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  29.55 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  35.42 
 
 
152 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  35.42 
 
 
152 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>