More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3071 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  598  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  47.62 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  44.59 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  47.62 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  41.92 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  47.83 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  37.7 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  46.94 
 
 		 151 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.45 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.45 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.45 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  28.01 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.49 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.55 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  44.67 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  41.57 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.13 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.49 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.35 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  35 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.8 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  35.41 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  31.6 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  39.07 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.52 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.33 
 
 		 151 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.3 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.13 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.24 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 128 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  38.19 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  38.19 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  33.11 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.93 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  40.99 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.01 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.93 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  32.38 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.23 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  32.09 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  28.62 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  36.22 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.72 
 
 		 148 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.52 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.21 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  38.89 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 162 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 148 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 128 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  40.97 
 
 		 152 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  32.57 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.15 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  39.86 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.66 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.87 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.19 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  32.33 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 140 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 138 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.95 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.46 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.13 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  34.2 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  36.11 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.67 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  29.37 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.15 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  28.33 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>