More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3072 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  303  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  46.62 
 
 
151 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  43.71 
 
 
295 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  42.38 
 
 
300 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  42.95 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  43.98 
 
 
317 aa  88.6  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  42.18 
 
 
303 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  44.16 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  44.37 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.57 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  44.37 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  44.1 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  43.15 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  38.56 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  43.66 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  35 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  36.42 
 
 
296 aa  77.4  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  36.62 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  38.03 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  34.39 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.84 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  34.39 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  30.46 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.39 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.27 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.94 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  36.05 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
151 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  38.99 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  32.39 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.29 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.11 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  33.77 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.45 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  34 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  35.76 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  31.13 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  35.95 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.1 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  41.1 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  40.69 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34.64 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  33.56 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.08 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  36.31 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 
288 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  30.61 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  31.94 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.91 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  37.09 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  36.55 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  33.33 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  31.21 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  31.21 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  33.33 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>